作者，Evil Genius今天我们更新脚本，量化不同状态之间的空间关系。我们解析一下：对于visium，直径是55um，一个spot内部是co-localization。临近的6个点，是adjacency。更大的范围（r = 2-15），区域组成，分析丰度之间的相关性。也就是说，随着区域面积增大，分析两种状态空间关系，识别出特定的尺度依赖性转变。当然分析两种状态关系可以两种细胞类型，或者同一细胞类型的两种亚型，或者就是通路得分。指标定义说明区域组成预设半径（默认8个六边形窗口）内，两种细胞类型的丰度相关性衡量大尺度共分布趋势邻接性一种细胞状态在另一种状态紧邻的邻域点（周围6个点）中的富集程度衡量边界/接触偏好共定位