告别代码焦虑让生信回归科学发现本身您是否也曾面临这样的困境手里攥着宝贵的转录组数据却被 Linux 复杂的命令行、R 语言无穷无尽的报错、以及服务器环境配置挡在了门外。明明是研究科学问题的生物学家却把大半时间耗费在了调试代码和查找报错信息上。生信分析本不该是少数人的特权。在“生信 3.0”云端时代技术门槛正在彻底瓦解。我们诚邀您加入《Galaxy 生信云平台 RNA-seq 实战班》这是一门专为零基础科研人员、临床医生及在校生打造的实操课。核心亮点•零代码纯视觉操作无需背诵代码无需配置环境。从质控、比对到定量全程在 Galaxy 云端通过“点击鼠标”完成非常容易上手。•上游到下游一站式通关不止是拿到表达矩阵我们还将教您如何通过平台内置工具零代码绘制出发表级的火山图、热图、PCA 图及富集分析图。•赋能湿实验进度拉满摆脱对分析公司的依赖告别网上杂乱无章的散碎教程。用最少的时间产出最专业的生信分析结果。课程内容本课程适合从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生。报名信息报名费用799 元。咨询微信客服【usegalaxy】报名。学员也可以付费本推文立即获得视频回放地址加客服补差价后进入学员交流群获得答疑支持。授课形式学员报名后先观看直播回放视频有问题在线会议答疑。学员福利• 保证学员能够完成一个转录组数据分析项目实战涵盖课程内容• 包教包会提供课程内容永久答疑服务• 加入学员专属交流群有问题随时沟通• 发票保证可以开培训、会议或数据分析发票授课老师简老师四川大学生物信息学硕士。10 余年行业深耕曾任职于诺禾致源、泛生子等顶尖机构。• 中国银河生信云平台UseGalaxy.cn创始人• 自媒体矩阵• 【简说基因】- 公众号• 【简说基因】- 知乎• 【简说基因】- 视频号• 【简说基因】- B站流程工具本课程的价值在于将转录组数据分析从原始数据开始到发表级图表所涉及的流程工具全部讲清楚让学员告别网上杂乱无章的零散教程。首先进入平台https://usegalaxy.cn找到“公共流程”页面搜索RNAseq即可看到所有可用的转录组流程有参转录组定量分析流程经典版经典流程采用的软件• fastp下机数据质控得到 Clean data。• hisat2将 Clean data 比对到参数基因组。• featureCounts定量分析。• multiQC质控结果汇总• FPKM/TPM/CPM Calculator计算 FPKM / TPM / CPM。• Merge RNA-seq Counts将单个样本表达量汇总成表达量矩阵。本流程有 PE Paired-End和 SESingle End两个版本分别用于双端测序数据和单端测序数据。• 双端测序数据每个样本有两个测序文件由 R1 和 R2 区分。• 单端测序数据每个样本只有一个测序文件。双端测序数据流程预览单端测序数据流程预览有参转录组定量分析流程STAR比对该流程与经典版本流程的区别在于使用的质控和比对软件不一样。两套流程的具体定量数值可能有差别但样本之间的趋势通常不会有变化。推荐优先使用经典版本。因为经典流程速度通常更快。• Trim galore 用于下机数据质控得到 Clean data。• STAR将 Clean data 比对到参考基因组上。双端测序数据流程预览单端测序数据流程预览无参转录组定量分析流程无参转录组流程使用的软件• Trim galore用于质控。• Kallisto用于定量。当然也可以将 Kallisto 更换为其他的基于无参的定量软件比如salmon 等。流程预览Galaxy 平台转录组流程的优点一键分析操作简单小白也能快速上手做转录组分析仅需上传数据选择参考基因组及对应的基因注释文件即可以开启分析用户无需准备其他材料。可视化流程运行图分析进程随时掌握流程运行整体视图每一个步骤还可以分析点击查看转录组下游分析工具经过上游分析拿到表达量矩阵后即可进行下游分析了。用户可以借助 R 语言完成平台也提供了非常丰富的转录组下游分析工具以下仅列出一些常用的。DEseq2 - 差异基因分析pyDEseq2 - Python版差异基因分析clusterProfiler - Y 叔基因富集分析三件套clusterProfiler bitr - 进行基因 ID 转换clusterProfiler enrichGO - 进行 GO 富集分析clusterProfiler enrichKEGG - 进行 KEGG 富集分析EnhancedVolcano Plot - 火山图绘制效果图PCA plot with FactoMineR - PCA 绘图效果图heatmap2 - 热图绘制WGCNA工具 - 加权基因共表达网络分析WGCNA流程 - WGCNA一键分析中国银河生信云平台精品课程中国银河生信云平台UseGalaxy.cn致力于生信平权。海量云端算力、8000生信工具结合AI推动生信进入3.0时代数据分析从本地到云端从手工到 AI。生信3.0时代交流群加入免费领取学习资料。左手代码右手云平台。特色生信培训助你丝滑发顶刊单细胞数据分析培训班Python/Galaxy可选不怕学不会咨询小助手usegalaxy腾讯会议直播课回放地址RNA-seq 第 1 期课程回放完结共 5 个视频第 1 次课录制2025-10-18-AM-Galaxy RNA-seq